熒光顯微鏡與普通光學顯微鏡不同，它不是通過普通光源的照明觀察標本，而是利用定波長的光(通常是紫外光、藍紫光)激發顯微鏡下標本內的熒光物質，使之發射熒光，所以，熒光顯微鏡的光源所起的作用不是直接照明，而是作為種激發標本的內熒光物質的能源。我們之所以能觀察標本，不是由于光源的照明，而是標本內熒光物質吸收激發的光能后所呈現的熒光現象。由此可知，熒光顯微鏡的特點，主要是它的光源能供給大量特定波長范圍的激發光，使受檢標本內的熒光物質能獲得必要強度的激發光。同時，熒光顯微鏡必須具備相應的濾光鏡系統。熒光顯微鏡是**熒光組織化學的基本工具。它是由超壓光源、濾片系統(包括激發和壓制濾板)、光學系統和攝影系統等主要部件組成，是利用定波長的光激發標本發射熒光。
1.激發熒光的方式：按光的波長范圍分為UV激發法(使用紫外線照明法)和BV激發法(使用藍紫光)兩種。UV激發法是用短于400nm的近紫外光進行激發。該法不存在可見的激發光，所以被觀察的熒光呈現該染料固有的熒光，容易判別標本上的特異熒光和背景組織的自身熒光。
2.BV激(ji)發法(fa)：是(shi)以(yi)404nm、434nm為中(zhong)心的(de)(de)(de)由紫(zi)外至藍光(guang)(guang)進行激(ji)發。該方法(fa)使(shi)用藍光(guang)(guang)照射標本，所(suo)(suo)(suo)以(yi)熒(ying)(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)觀察系統(tong)的(de)(de)(de)截止濾光(guang)(guang)片必(bi)須(xu)使(shi)用可(ke)完全阻斷藍光(guang)(guang)并可(ke)充(chong)分通過所(suo)(suo)(suo)需綠、黃熒(ying)(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)的(de)(de)(de)濾光(guang)(guang)片。用于熒(ying)(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)抗體法(fa)的(de)(de)(de)熒(ying)(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)色(se)(se)素(su)。對(dui)于激(ji)發光(guang)(guang)的(de)(de)(de)大(da)吸收(shou)波長(chang)和熒(ying)(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)的(de)(de)(de)大(da)發光(guang)(guang)波長(chang)比較接近，所(suo)(suo)(suo)以(yi)BV激(ji)發法(fa)使(shi)用的(de)(de)(de)濾光(guang)(guang)片必(bi)須(xu)使(shi)用銳截止式(shi)濾光(guang)(guang)片。該法(fa)可(ke)用藍光(guang)(guang)作為激(ji)發光(guang)(guang)，所(suo)(suo)(suo)以(yi)熒(ying)(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)色(se)(se)素(su)的(de)(de)(de)吸收(shou)效率(lv)較，可(ke)得到(dao)較明(ming)亮(liang)的(de)(de)(de)圖(tu)像。其(qi)缺點是(shi)500nm以(yi)下的(de)(de)(de)熒(ying)(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)無法(fa)看到(dao)，而500nm以(yi)上的(de)(de)(de)使(shi)整個(ge)圖(tu)像顯黃色(se)(se)。在熒(ying)(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)抗體法(fa)中(zhong)，大(da)多以(yi)熒(ying)(ying)(ying)(ying)光(guang)(guang)色(se)(se)素(su)特(te)有的(de)(de)(de)顏色(se)(se)來判斷其(qi)特(te)異性，所(suo)(suo)(suo)以(yi)在討論微妙的(de)(de)(de)特(te)異性時，上述BV激(ji)發法(fa)的(de)(de)(de)缺點往(wang)往(wang)影響大(da)。

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